Hallo,
ich hatte mit meiner Dicken (BJ 2009, erworben 2017) ähnliche Probleme:
Spannung beim Starten i.O. - dann im Betrieb nach ca. 100 - 200 km z.T. unter 12V.
Diagnose Honda-Werkstatt: Lima defekt

Da nicht billig selbst ausgebaut und selbst durchgemessen = alle Werte iO???? - Neuen Regler (gebraucht) besorgt und zum "Schrauber meines Vertrauens" gebracht: neuer Regler ist besser - LiMa ok. ???????
Zur Kontrolle ein digitales Voltmeter (Tante L.) verbaut: Spannung schwankt weiter...
Anfang dieses Jahres dann die Lösung durch Zufall beim Umbau eben dieses Multimeters: der Honda-Händler hatte 2009 bei Auslieferung eine Bordsteckdose eingebaut und die Masse einfach an das Geweih angeschraubt, OHNE die Farbe abzukratzen (= kein richtiger Masseschluss). Dahinter hatte ich dann Navi, USB etc. angeschlossen.
Nachdem ich das Ganze dann komplett abgeklemmt und das Kabel direkt am Zündschloss sowie der Batterie angeklemmt habe, habe ich in allen Fahrtzuständen und Kilometern wieder 13,9 - 14,1 V anliegen!
Vielleicht kann es ja auch bei dir an ähnlichen Problemen liegen? Denn Kabelbaum "komplett" ist ja schon etwas heftig:(
Beste Grüße und allzeit gute Fahrt,
Ralf